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SnapGene Viewer
SnapGene Viewer
  • 版本:5.0.5
  • 大小:52.4MB
  • 支持度:87 %
  • 更新:2025-10-28
软件介绍

snapgene viewer是一款质粒图谱绘制工具,专注于为分子生物学研究者提供基础的 dna 序列查看、注释和共享功能。

免费查看与注释

用户可免费创建、浏览和共享注释的 dna 序列文件,支持质粒图谱的直观展示。

内置特征数据库,支持自动注释公共特性(如启动子、抗性基因、开放阅读框 orfs 等)。

跨平台协作

支持与同事或客户共享 snapgene 格式的文件,促进团队协作。

可导出为图像(如 png、jpeg)或标准格式(如 genbank、fastq),方便数据传播。

可视化工具

提供多种视图(如图谱、序列、酶切位点、引物等),帮助用户全面理解 dna 结构。

图谱视图支持环形或线性展示,标注关键元件(如多克隆位点 mcs)和酶切位点。

与付费版互补

viewer 版作为付费版的补充,满足基础查看需求,而付费版则提供更全面的编辑、克隆模拟和高级分析功能。

文件支持

导入格式:支持 genbank、fastq、snapgene 格式(.dna)、测序文件(.ab1、.scf)等。

导出格式:可导出为图像(png、jpeg)、标准格式(genbank、fastq)或 snapgene 格式文件。

视图与导航

图谱视图:展示质粒的环形或线性结构,标注关键元件和酶切位点,支持缩放和细节查看。

序列视图:显示详细的 dna 序列,支持搜索特定序列或注释,并可编辑(仅付费版支持)。

酶切位点视图:列出所有限制性内切酶的识别位点,支持按数量或存在性筛选,深色标记单一位点,浅色标记多位点。

引物视图:展示已设计的引物信息,如位置、gc 含量、tm 值等,支持引物比对和验证。

注释与编辑

自动注释:识别公共特性(如 orfs、启动子)并标注,减少手动操作。

手动注释:允许用户自定义特性(如基因、utr),调整颜色和标签以增强可读性。

引物设计:支持设计 pcr、测序或诱变引物,并标注在序列上,付费版支持引物模拟和验证。

分析与模拟

序列比对:支持多序列比对(dna 或蛋白质),选择算法(如 clustal omega、mafft),生成比对结果和统计报告。

翻译预测:显示可能的编码区,支持调整参数以预测非编码 rna(如 lncrna、circrna)。

电泳模拟:模拟限制酶切消化或 pcr 扩增的结果,生成虚拟凝胶图像,辅助实验设计。

数据管理

搜索与过滤:快速定位特定序列、酶或引物,支持关键词搜索和高级过滤。

历史记录:跟踪所有编辑和操作,支持撤销和重做,确保数据可追溯。

批量处理:对多个文件执行相同操作(如格式转换、注释统一),提高工作效率。

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